SYBR Green I：這是一種較為常用的核酸染料，屬于花箐類染料。它能與雙鏈 DNA（dsDNA）小溝結(jié)合，結(jié)合后熒光信號(hào)會(huì)顯著增強(qiáng)，靈敏度較高，可檢測(cè)到低至皮克級(jí)的 dsDNA 。SYBR Green I 適用于實(shí)時(shí)熒光定量 PCR（qPCR），在 PCR 反應(yīng)過程中，它會(huì)隨著雙鏈 DNA 的合成不斷嵌入，通過檢測(cè)熒光強(qiáng)度變化，實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè) PCR 進(jìn)程。不過，SYBR Green I 也存在一定局限性，它不僅能與 dsDNA 結(jié)合，還會(huì)與單鏈 DNA（ssDNA）、RNA 發(fā)生非特異性結(jié)合，可能產(chǎn)生較高的背景信號(hào)，影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果的準(zhǔn)確性，因此在使用時(shí)需注意優(yōu)化實(shí)驗(yàn)條件 。

GoldView：是一種可替代 EB 的核酸染料，分為 GoldView I 和 GoldView II 。GoldView I 適用于瓊脂糖凝膠電泳染色，其靈敏度與 EB 相當(dāng)，能清晰顯示核酸條帶。與 EB 相比，GoldView 的細(xì)胞毒性較低，對(duì)實(shí)驗(yàn)人員和環(huán)境相對(duì)友好。它在紫外光激發(fā)下可發(fā)出綠色熒光，操作較為簡便。但 GoldView 的穩(wěn)定性相對(duì)較差，長時(shí)間儲(chǔ)存可能會(huì)影響染色效果，且在某些實(shí)驗(yàn)條件下，其熒光強(qiáng)度可能不如一些新型核酸染料 。

GelRed 和 GelGreen：這兩種染料均為花箐類二聚體核酸染料，具有高靈敏度、低毒性的特點(diǎn)。GelRed 專用于 dsDNA 染色，GelGreen 則可用于 dsDNA、ssDNA 和 RNA 染色 。它們的分子結(jié)構(gòu)使其能夠緊密結(jié)合核酸，染色后條帶清晰，背景信號(hào)低，尤其適用于高分辨率瓊脂糖凝膠電泳和聚丙烯酰胺凝膠電泳。此外，GelRed 和 GelGreen 可被標(biāo)準(zhǔn)的紫外凝膠成像系統(tǒng)和藍(lán)光透射儀激發(fā)，使用方便，且在實(shí)驗(yàn)過程中對(duì)核酸遷移的影響較小，能準(zhǔn)確反映核酸片段的大小 。

SYBR Safe：是一種安全型核酸染料，常用于瓊脂糖凝膠電泳和聚丙烯酰胺凝膠電泳染色。它的化學(xué)穩(wěn)定性高，與多種電泳緩沖液兼容 。SYBR Safe 對(duì)細(xì)胞的毒性較低，且致突變性極弱，在保障實(shí)驗(yàn)人員安全方面表現(xiàn)良好。該染料靈敏度高，能檢測(cè)到微量核酸，并且與核酸結(jié)合后，在藍(lán)光或紫外光激發(fā)下可產(chǎn)生強(qiáng)熒光信號(hào)，適用于從核酸分離到回收的多種實(shí)驗(yàn)流程 。不過，SYBR Safe 在 qPCR 中的應(yīng)用相對(duì)較少，主要還是集中在凝膠電泳檢測(cè)領(lǐng)域 。